多发性机会性感染患者具有一种独特的病理特征，那就是他们极易受到那些对普通人群并无威胁的病原体的侵袭。这种情况常常导致一系列复杂的感染症状。
在肺部，卡氏肺囊虫感染尤为常见，约占患者总数的50%。还有一小部分患者可能面临由巨细胞病毒、鸟类分枝杆菌和新型隐球菌引发的广泛性肺炎的威胁。这些病原体导致的疾病如鼠弓浆虫感染、隐球菌性脑炎以及脑膜炎胞病毒引发的进行性多灶性白质脑病，都可能是致命的。更令人担忧的是，HIV病毒也可能直接引发脑病痴呆和脑膜炎，严重威胁患者的生命安全。
除了上述的肺部感染，消化系统也极易受到侵袭。念珠菌性口腔炎、食管炎、隐孢子虫肠炎等消化道感染屡见不鲜。患者还可能面临细菌性痢疾、伤寒、病毒性肝炎以及传播性结核病的威胁。
除了上述感染性疾病，恶性肿瘤也是这类患者的一大困扰。Kaposi肉瘤是一种常见的恶性肿瘤，由血管内皮细胞和外皮细胞的异常增生形成。这种病变通常从足部皮肤开始，呈现紫蓝色或棕红色的多发性结节，并可能广泛扩散到身体的其他部位。恶性淋巴瘤也是常见的并发症之一。
多发性机会性感染患者面临着比一般人群更为复杂和严重的健康挑战，需要特别关注和精心的治疗。
