近年来，粪菌移植（FMT）在自闭症治疗领域的研究取得了显著进展，以下是的关键发现和临床应用情况：
解放军总医院杨光教授团队于2024年发表的随机双盲对照研究首次证实，口服粪菌胶囊可显著改善孤独症儿童的核心症状，包括社交能力、语言表达和日常生活技能。研究显示，FMT组患儿在17周后的行为量表评分优于安慰剂组，且肠道菌群多样性明显提升。类似案例中，一名16岁自闭症患儿通过粪菌移植后，从特殊教育学校成功转入普通学校就读。
粪菌移植通过“脑肠轴”调节自闭症症状的理论得到进一步支持。健康菌群移植可修复肠道微生态紊乱，进而通过代谢产物、免疫调节和神经递质（如五羟色胺）影响大脑功能，改善情绪和社交障碍。临床观察发现，65%以上伴有消化道症状（如便秘、食物不耐受）的自闭症儿童在接受FMT后，核心症状和消化问题同步缓解。
尽管FMT短期安全性较高（不良发生率与安慰剂相当），芝加哥大学2025年研究警示，移植的菌群可能长期定植于非原生肠道区域，改变宿主代谢和能量平衡，需谨慎评估个体适应性。目前，解放军总医院等机构已建立严格的菌群筛选和胶囊制备流程，降低风险。
上海儿童医院等机构正加速临床试验，计划2025年为60名患儿提供免费FMT治疗，并呼吁健康人群捐赠粪便以扩大菌源库。研究范围已从自闭症拓展至抑郁症、焦虑症等神经精神疾病。
个性化菌群移植和精准医疗成为重点，例如通过宏基因组检测匹配供受体菌群特征。胶囊制剂技术的优化（如离心干燥工艺）有望提升治疗便捷性。
