针对Cydia在“准备文件系统”阶段出现的问题，结合常见的解决方法，我们可以进行如下操作：
我们要确保网络环境稳定。Cydia需要稳定的WiFi环境来下载和安装文件，避免在数据流量或信号弱的网络环境下使用，以防文件下载中断。为了防止进程被中断，我们可以关闭设备的自动锁定功能，路径为：设置 > 通用 > 自动锁定 > 永不。
如果Cydia在首次打开时卡住，可能是因为系统需要完成初始化配置。我们可以尝试重启设备后再次尝试打开。如果仍然卡住，那么我们需要进行强制重启：对于iPhone 8及更早的机型，按住Home键+电源键；对于全面屏机型，按住音量键+电源键，直到出现Apple标志。
我们需要检查是否缺少某些依赖插件。重启后进入Cydia，添加源`apt.25pp`，搜索并安装Apple File Conduit 2（修复文件系统访问权限）。部分版本可能还需要安装AppSync Unified（ipa签名补丁）或afc2add（增强文件管理支持）。
如果上述方法都无效，我们建议完全卸载iTunes及相关驱动后重新安装。如果问题仍然存在，可以通过DFU模式恢复系统并重新越狱。在越狱时，我们应优先选择稳定的工具版本，避免因为工具缺陷导致Cydia异常。
我们还需要注意一些细节问题。首次运行Cydia时，如果提示身份选择，我们应优先以“用户”身份登录，避免开发者模式权限冲突。在添加第三方源时，一定要注意源地址的有效性，失效的源会导致依赖包安装失败。部分旧版越狱工具可能存在兼容性问题，因此建议参考当前主流工具（如Checkra1n、unc0ver）的官方指南进行操作。
解决Cydia卡在“准备文件系统”的问题需要结合具体的情境进行多种方法的尝试。相信通过以上的方法，大部分问题都可以得到妥善的解决。为了保证操作的顺利进行，我们还需要注意一些操作细节，以免造成不必要的麻烦。
