胚胎期的特殊发育过程，决定了心血管系统的形成。其中，原始动脉干的发育状况尤为重要。在胚胎的第三周和第四周，正常情况下，动脉干间隔逐渐发育成熟，将原始动脉干分为主动脉和主肺动脉两大分支。这一过程涉及从锥形到头部螺旋的复杂生长模式，使得主动脉位于左后方，主肺动脉则位于右前方。这一过程也涉及到动脉干间隔与锥形间隔的紧密相连，共同参与到膜室间隔的形成中，进而关闭室间孔。
当胚胎发育过程中，心球纵隔缺失或发育不全时，就会出现特殊的病理情况。这种情况下，动脉干无法按照正常路径发育，导致室间隔出现高缺陷。这时，动脉干就像骑跨在室间隔缺陷之上，可能导致血液流动异常。动脉干的半月瓣原本应该是3瓣，但也可能出现2~6瓣的畸形变异。动脉导管也可能缺失，即便存在也往往不能发挥正常功能。
肺动脉的发育也可能出现异常。有时，肺动脉可能从动脉干的根、干部或弓部无法正常分离，甚至可能出现肺动脉不发育的情况。在永久性动脉干的情况下，肺循环的血液可能仅来自扩张的支气管动脉。永久性动脉干的类型各异，但无论其属于何种类型，身体循环、肺循环和冠状动脉的血液都源自心室和动脉干。这些复杂的生理过程在胚胎发育阶段就已经确定下来，对个体的生理健康产生深远影响。
心脏和血管系统的发育是一个复杂而精细的过程。一旦出现发育异常或缺陷，就可能引发一系列健康问题。对于这类疾病的研究和预防工作至关重要。
